選択肢を選ぶ操作が出来ない（終了等は出来る）

もし、ジョイパッドなどの外部デバイスを使用しているのなら、ジョイパッドの設定値がおかしい場合が考えられます。
一度、ジョイパッドを外してからお試しください。
ジョイパッドを繋いでいない場合でも、他デバイスがあるようなら外してみて下さい。
ジョイパッドやその他デバイスに専用ドライバがある場合、更新してみて下さい。

マリアの武器、サーナキアの防具が買えません。

この二つに関しては、購入する事が出来ません。
マリアの武器は、マリアが開発している物であり一般には売られていません。
サーナキアの防具は古き時代の物であり彼女の思い出の品です。
（システム上、買い物欄では、すべて購入済みになっています）

見たはずイベントのＣＧが登録されない

「ランス６」では、イベントを見ただけではＣＧ登録されず、イベントを見た後にセーブして初めて登録されます。
セーブする前にゲームオーバーになったり、別のセーブデータをロードしてしまうとＣＧは登録されません。

女の子のレベルが５０以上上がらない

ランス君といえども限界はあります。
というわけで、仕様です。

プリマの好感度ボーナス簡易治療の能力アップを選ぶと回復量が下がる

申し訳ありません、バグです。
［修正ファイル］で改善されます。

戦闘時の行動選択コマンド「何もしない」が特定のキャラクターで表示されない

「何もしない」コマンドが表示されないのは仕様です。

キャラクター上に表示される選択肢は表示される数制限があり、スキルを多く取得しているとそちらが優先されるので、行動コマンドが多い時は「何もしない」が出なくなります。

画面レイアウト上の制限でこちらの努力不足ではありますが、今回はこういう仕様という事でよろしくお願いします。

特殊キャラ参加の戦闘時にパーティ編成をすると仲間がいなくなったりエラーになる

通常仲間になっていないキャラが、イベント戦闘でその時だけ参加するイベント戦闘の時に 仲間を呼ぶを選び、パーティ編成をするとそのキャラが外れてしまいます。
また戦闘可能なキャラが他にいない状況などになると場合によってはエラーで止まります。

［修正ファイル］で改善されます。

音が鳴らなくなった。

オーディオの詳細設定にある「ハードウェア アクセラレータ」のつまみを下げてお試しください。

詳しくは、サポート［■ 音楽、効果音等に関する事］の、以下の２項目を参照して下さい。
　⇒ ボリュームの設定が正しく反映されない、動作が不安定になる
　⇒ ゲーム中にフリーズする

「Sys42VMエラー」または「命令コード【 DIV 】でO除算が発生しました」と表示されてゲームが止まる。

必要なデータが正しくインストール出来ていないようです。
セーブデータを待避後、再インストールしてみて下さい。

症状が改善されない場合は、インストールの際にデータの一部が正しく書き込めていない可能性が高いです。
DVD-ROMのGAMEDATAフォルダの中身を、手動でインストール先へ上書きコピーして試してみてください。
（コピー後、ファイルの属性を読み込み専用属性を解除して下さい）

念の為、スキャンディスク・デフラグ等で、ハードディスクへの書き込みが正しく行えるかご確認下さい。

ダンジョンに入る前、「読み込み中」の画面のまま先に進まない。もしくは止まる。
または、読み込みは終了するが、探索画面が真っ暗でプレイ出来ない。

必要なデータが正しくインストール出来ていないようです。
セーブデータを待避後、再インストールしてみて下さい。

症状が改善されない場合は、インストールの際にデータの一部が正しく書き込めていない可能性が高いです。
DVD-ROMのGAMEDATAフォルダの中身を、手動でインストール先へ上書きコピーして試してみてください。
（コピー後、ファイルの属性を読み込み専用属性を解除して下さい）

念の為、スキャンディスク・デフラグ等で、ハードディスクへの書き込みが正しく行えるかご確認下さい。